Arrangement régulier résultant des angles de liaison du lien peptidique. Structure en hélice (plus commune, liaisons H entre NH et CO de 2 liaisons peptidiques sur la même chaîne, élastique) ou en feuillets (liaisons H entre NH et CO de 2 liaisons peptidiques soit sur 2 chaînes différentes, soit sur 2 segments éloignés, inextensible). Possible de retrouver les deux types de structure dans une même protéine.

Séquence linéaire ordonnée de ses acides aminés.

= Copolymères d’acides aminés (différant entre-eux par R). Acides aminés = Molécules chirales : 2 formes (énantiomères L et D : Tous type L chez les êtres vivants). Condensation de 2 acides aminés = Dipeptide (liaison peptidique entre groupement carboxyle et aminé). Polypeptides = Longues chaînes d’acides aminés.

Plusieurs fonctions : Enzymes (=Catalyseurs, classe la plus importante et diversifiée, se retrouvent intactes à la fin de la réaction), structurales, hormones, transport, …